Dirbant su paketais pasitaiko situacijų, kai po portupgrade programos darbo ar kitų pakeitimų nebeįmanoma įdiegti naujų paketų, tuomet padeda ši komanda:

pkgdb -fu

Kartais susimaišo paketų ryšiai su kitais paketais tuomet, kad viską sutvarkyti prašoma naudotis šia komanda:

pkgdb -F

Kartu ryšius padeda sutvarkyti ir patikrinti ši komanda:

pkgdb -L